根据各地的反映和要求，现对城市商业银行企业所得税几个业务问题明确如下：
一、关于费用扣除问题。城市商业银行在计算应纳税所得额时，准予扣除的项目，一律按照税收法规的规定执行。财务、会计制度规定的列支项目、标准与税收法规规定不一致的，应按税收法规规定进行纳税调整。有关部门和企业的费用考核指标，不能作为税收扣除标准和计算征税的依据。
二、关于固定资产购建问题。按照现行财务制度规定，固定资产净值与在建工程之和占所有者权益（扣除未分配利润）的比例最高不得超过50%。考虑到历史与现状，个别城市商业银行因情况特殊超过了规定的比例，应报经省级国家税务局批准。凡未经省级国家税务局批准的，对超过规定比例部分增提的折旧，一律要进行纳税调整，不得在税前进行扣除。
三、关于应收应付利息处理问题。由于今年存贷利率进行了调整，城市商业银行对未到期跨年度的贷款在逐笔计算应收利息时，其利率按借款合同所规定的利率执行。同时，对已形成呆滞、呆账贷款应收未收挂账利息要及时进行处理，凡符合坏账条件的，要按规定及时进行核销。应付利息的提取可按各档次存款执行利率加权数（平均利率）计算，有条件的城市商业银行也可逐笔计算。对提取的应付利息不足支付到期存款实付利息的差额部分，可直接在税前扣除。
四、关于安全防范费扣除问题。城市商业银行出于安全防范需要所购置的安全保卫器械、安装营业网点的防护门窗及柜台栏杆、消防专用设备、保安人员工资以及经批准的其他防范费用，在计算当期企业所得税时允许直接扣除，个别项目费用过大，可以在二年内分期扣除。
城市商业银行购置的监控设备，应单独计算其价值，作为固定资产进行管理，不得列为安全防范费直接在税前扣除。
五、关于奖金扣除问题。符合下列规定的城市商业银行，可以按规定据实扣除奖金。
（一）必须是经济效益好、不良贷款比例低、抗风险能力强的城市商业银行。亏损城市商业银行，不得在税前据实列支奖金。
（二）必须以纳税人为单位计算税前据实列支的奖金。以支行为纳税人的，各支行之间不得相互调济奖金。
（三）城市商业银行税前据实列支的奖金最高不得超过税前利润（不含此项支出）的8%，其中，不超过5%的，由各省、自治区、直辖市和计划单列市国家税务局审批。个别经济发达地区的城市商业银行如因情况特殊需要提高比例的，由各省、自治区、直辖市和计划单列市国家税务局上报国家税务总局审批。
自1999年度起，各城市商业银行不再执行工效挂钩办法，一律实行计税工资办法。计税工资标准按现行税收规定执行。上述奖金不计入计税工资总额。
六、关于国库券收入处理问题。城市商业银行直接向国家（一级市场）认购的国库券利息收入，可用于抵补以前年度的亏损，抵补以前年度亏损有结余的部分，免征企业所得税。城市商业银行在二级市场上买卖国库券所取得的收益，应计入当期损益，按规定缴纳企业所得税。
城市商业银行因办理国库券业务而取得的手续费收入，应计入当期损益，按规定缴纳企业所得税。同时，因办理此项业务而发生的支出，可在税前扣除，包括：宣传、会议、奖励、人员培训费等支出。
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